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本篇将 AMPK 通路定位为细胞能量感应与代谢重编程的核心枢纽，从 “AMPKα Thr172 激活 → 直接底物 ACC / ULK1 / Raptor → mTORC1、脂肪酸代谢与自噬输出” 的链路，梳理出一套适合常规实验与药效评估的指标组合。文章系统整理 LKB1 状态、p-AMPKα(Thr172)、total AMPKα、p-ACC(Ser79)、p-ULK1(Ser317/Ser555)、p-Raptor(Ser792) 以及 mTORC1 下游 p-S6K1/p-4E-BP1、自噬通量 marker（LC3B-II、p62）和代谢 readout（葡萄糖摄取、乳酸、ATP、OCR/ECAR）等关键 readout，并分别针对“能量压力 / AMPK 激动剂”“AMPK–自噬轴”“AMPK–mTOR 交叉调控”“代谢重编程与细胞命运”给出可直接套用的 panel 设计思路。最终提炼出以 p-AMPKα(Thr172) + total AMPKα 为核心，配合 p-ACC、一个 mTORC1 readout（p-S6K1 或 p-4E-BP1）以及自噬或代谢功能指标的 AMPK 通路「必备四件套」，帮助在能量代谢、肿瘤、代谢性疾病等课题中高效判断 AMPK 是否被有效激活及其功能后果。

本篇聚焦 Stress MAPK（JNK/p38）在氧化应激、紫外线、细胞因子和毒性药物等场景下的经典检测指标，从上游 MKK4/7、MKK3/6，到 p-JNK/p-p38，再到 p-c-Jun、p-ATF2、p-MK2 及 AP-1 活性，系统梳理“应激三连击”与下游功能输出的 readout 组合。文章按照 UV/ROS 模型、LPS/细胞因子炎症模型、化疗药物诱导凋亡和 JNK/p38 抑制剂药效验证四类实验场景，给出可直接套用的 panel 设计，并对比 Western blot、免疫荧光、报告基因、ELISA 与流式凋亡检测在不同研究问题下的选型思路，方便快捷搭建应激与炎症相关的信号通路指标库。

本篇以 Wnt/β-catenin 通路为主线，同时特别强调 Wnt5 相关的非经典信号分支。文章列出 β-catenin 核转位、TCF/LEF 报告基因活性、Axin2/c-Myc/Cyclin D1 等靶基因表达作为经典 readout，并补充 Wnt5a 介导的极性与迁移相关指标。适合用于肿瘤干细胞、发育生物学和 EMT/侵袭研究场景，便于快速搭建 Wnt panel。

本篇专注于自噬本身的指标体系，而不是重复 mTOR 机制，重点讲清 “启动（ULK1）→ 成核与延伸（Beclin1、ATG5-12）→ 自噬小体/通量（LC3-II、p62、溶酶体）” 三段 readout。文章强调自噬研究必须结合 BafA1/CQ 等抑制剂看 flux，而不能只看 LC3-II 高低，并设计饥饿/Rapamycin、自噬通量评估、线粒体自噬和 ATG 基因敲除等 panel。适合搭配 WB、IF/高内涵、EM 和 Cyto-ID 染色等平台，用于肿瘤、代谢疾病和器官保护课题。

本篇聚焦 PI3K/AKT 作为生长因子与代谢信号主干，从 p-AKT（Ser473/Thr308）、mTORC1 下游 p-S6K1/p-4E-BP1，到 FOXO 核转位与 GSK3β 磷酸化等 readout 一一拆解。文章按照 “生长因子/胰岛素刺激”“PI3K/AKT 抑制剂”“PTEN 功能丧失” 等典型场景设计 panel，并给出 WB、IF/核转位检测与代谢 readout（葡萄糖摄取、脂质合成）的组合建议。适合肿瘤、代谢疾病以及靶向 PI3K/AKT/mTOR 药物研究。

本篇围绕线粒体通路凋亡，将上游 BCL-2 家族平衡、MOMP 与 Cyt c 释放、中游 Caspase-9 激活和终末 Caspase-3/PARP 裂解、Annexin V/PI/TUNEL 等 readout 串成一条清晰链路。文章拆分 “DNA 损伤→p53 依赖凋亡”“线粒体毒性”“BCL-2 抑制剂/BH3 mimetic”“内源性 vs 外源性凋亡鉴别” 四种 panel，并给出 WB、流式、IF/组织染色和克隆形成等平台的组合建议。适用于肿瘤药物、抗凋亡耐药机制和 BCL-2 靶向治疗研究。

本篇把 DDR 通路压缩到 “损伤标记（γH2AX、53BP1）→ 传感与转导（ATM/ATR–CHK1/CHK2）→ 输出（p53–p21–细胞周期阻滞与凋亡）” 三个关键层级，系统整理常用磷酸化位点和焦点（foci） readout。文章设计放疗/电离辐射、复制压力、DNA 损伤化疗药物和 DDR 抑制剂四类 panel，并给出 WB、IF/共聚焦、流式细胞周期、彗星实验和克隆形成等平台的搭配建议。适合肿瘤放化疗敏感性、DDR 抑制剂和合成致死研究场景。

本篇围绕 cGAS–STING 通路，梳理从胞质 DNA 识别、cGAMP 生成、STING 激活，到 TBK1–IRF3 轴和 IFN-β / ISGs 表达的关键 readout。重点列出 p-TBK1、p-IRF3、IRF3 核转位、IFN-β 与典型干扰素刺激基因（ISG15、MX1、OAS1 等）的检测组合，并对比 WB、qPCR、ELISA 与 reporter assay 在抗病毒、小分子抑制剂和肿瘤免疫课题中的使用场景。适合作为 “DNA 感知–干扰素” 模块的标准指标清单。

本篇聚焦 NLRP3 炎症小体的完整 readout 链条：从 NF-κB 介导的 priming（NLRP3 与 pro-IL-1β 上调），到 ASC speck 形成、Caspase-1 激活，再到 GSDMD 裂解、IL-1β / IL-18 释放和 LDH 释放型焦亡。文章拆分 LPS+ATP 急性模型、结晶/代谢性疾病模型、感染模型以及 NLRP3 抑制剂验证四类常见 panel，并对比 WB、IF/共聚焦、流式 FLICA 探针和 ELISA/LDH 试验的选型思路。适合做痛风、NAFLD、炎症性疾病和小分子炎症小体抑制剂开发的指标参考。

本篇将 mTOR 定位为细胞营养感应与生长调控的核心节点，从 p-mTOR、p-p70S6K、p-S6、p-4E-BP1 到 p-ULK1、LC3-II/p62、p-AKT、p-AMPK，系统梳理“上游生长因子–mTORC1 核心–翻译/自噬下游”的常用 readout 组合。文章给出生长因子/血清刺激、mTOR 抑制剂给药、自噬相关课题等典型 panel 设计，并对比 Western blot、流式和免疫组化在通路纵向扫描、单细胞分析和组织空间定位上的适配场景，最后提炼出 mTOR 通路的“必备四件套”，便于快速验证模型是否拉起或有效抑制。