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本篇围绕 Notch 配体–受体结合后 γ-secretase 介导裂解、NICD 核转位和 Hes/Hey 系列靶基因表达，整理了 Notch 通路最常用的检测组合。文章区分激活型 vs 抑制型操作（配体刺激、γ-secretase 抑制剂、NICD 过表达），给出 WB、IF、qPCR 与 reporter 的 panel 搭配，适合发育、造血、神经干细胞以及 Notch 相关肿瘤研究。

本篇将 TGF-β/Smad 通路定位为纤维化、上皮–间质转化（EMT）、肿瘤侵袭和免疫抑制研究中的关键信号轴，围绕 “TGF-β 配体与受体激活 → Smad2/3 或 Smad1/5/8 磷酸化 → Smad 复合体核转位 → 靶基因与纤维化/EMT 表型” 梳理了高频使用的 readout 组合。文章系统列出 TGF-β1 水平、p-Smad2/3、p-Smad1/5/8、Smad2/3/4 核转位、Smad7 负反馈、CAGA-luc 报告基因，以及 PAI-1、COL1A1、FN1 和 EMT 标记（E-cadherin、N-cadherin、Vimentin、Snail/Slug）等指标，并按“短期 TGF-β 刺激”“器官纤维化模型”“EMT 与肿瘤侵袭”“TGF-β/Smad 抑制剂验证”设计了可直接套用的 panel。结合蛋白免疫印迹、免疫荧光/免疫组化、报告基因、ELISA 与功能实验，本篇提炼出以 “p-Smad2/3 + Smad 核转位 + CAGA-luc/纤维化靶基因 + EMT/ECM 表型” 为核心的 TGF-β/Smad 通路「必备四件套」，方便在纤维化与肿瘤相关课题中快速判断通路是否被有效激活或阻断。

本篇将 Hippo/YAP 通路定位为调控组织大小、器官再生与肿瘤发生的关键信号轴，围绕 “MST1/2–LATS1/2 激酶级联 → YAP/TAZ 磷酸化与胞浆滞留 → TEAD 靶基因表达” 梳理核心 readout。文章系统列出 p-MST1/2、p-LATS1/2、p-MOB1、p-YAP(Ser127/Ser397)、p-TAZ(Ser89)、YAP/TAZ 核/浆定位、TEAD 报告基因活性以及 CTGF/CYR61/ANKRD1 等经典靶基因，并分别针对细胞密度/接触抑制、基质刚度/机械力、YAP/TAZ 过表达或敲除、Hippo/YAP 抑制剂与 PROTAC 药效验证设计可直接套用的 panel 组合。结合 Western blot、免疫荧光/免疫组化、报告基因与功能实验，提炼出 “p-YAP ± p-LATS + total YAP/TAZ + 核定位 + TEAD/靶基因” 的 Hippo/YAP 通路「必备四件套」，帮助快速判断 YAP/TAZ 是否被有效激活或抑制。

本篇将 JAK/STAT 定位为细胞因子与干扰素信号的核心通路，围绕 “p-JAK + p-STAT（酪氨酸位点）+ STAT 核转位 / SOCS1/3 负反馈” 梳理一套高频使用的 readout 组合。文章按 IFN–STAT1、IL-6/IL-10–STAT3、IL-2/造血生长因子–STAT5 等不同细胞因子轴设计 panel，并给出 JAK 抑制剂药效验证的指标搭配思路。结合蛋白免疫印迹、磷酸化流式和免疫荧光 / 免疫组化在单细胞与组织层面的优势，最终提炼出 “p-STAT + total STAT + p-JAK + STAT 核转位 / SOCS” 的 JAK/STAT 通路「必备四件套」，方便快速判断通路是否被有效拉起或阻断。

本篇将 MAPK/ERK 支路定位为「生长因子–受体酪氨酸激酶–肿瘤增殖」的核心通路，围绕 p-ERK1/2 与 p-MEK1/2 梳理从 RTK–Ras–Raf–MEK–ERK 级联到下游 p-p90RSK、ERK 核转位的常用 readout。文章分别针对生长因子刺激、MEK/ERK 抑制剂验证及肿瘤样本 ERK 激活设计可直接套用的 panel，并对比 Western blot、流式细胞术与免疫荧光 / 免疫组化在时间梯度、单细胞分析和组织定位中的使用场景，最终提炼出 p-ERK1/2、总 ERK1/2、p-MEK1/2 与 p-p90RSK / ERK 核转位这一套「最小但够用」的 ERK 通路指标组合。

本篇系统整理 Hedgehog 通路从配体（Shh/Ihh/Dhh）、受体 PTCH1/2、信号传导蛋白 SMO 到转录因子 GLI1/2/3 的关键 readout，强调 GLI1 与 PTCH1 mRNA、GLI1/2 核定位和 GLI-luc 报告活性这几项高频使用指标。文章区分 Shh 配体刺激、SMO 激动剂/抑制剂、GLI 直接调控以及肿瘤/干细胞模型四类 panel，并加入初级纤毛标记的 IF 方案。适合发育生物学、干细胞维持以及 Hedgehog 依赖肿瘤药物开发。

本篇将 AMPK 通路定位为细胞能量感应与代谢重编程的核心枢纽，从 “AMPKα Thr172 激活 → 直接底物 ACC / ULK1 / Raptor → mTORC1、脂肪酸代谢与自噬输出” 的链路，梳理出一套适合常规实验与药效评估的指标组合。文章系统整理 LKB1 状态、p-AMPKα(Thr172)、total AMPKα、p-ACC(Ser79)、p-ULK1(Ser317/Ser555)、p-Raptor(Ser792) 以及 mTORC1 下游 p-S6K1/p-4E-BP1、自噬通量 marker（LC3B-II、p62）和代谢 readout（葡萄糖摄取、乳酸、ATP、OCR/ECAR）等关键 readout，并分别针对“能量压力 / AMPK 激动剂”“AMPK–自噬轴”“AMPK–mTOR 交叉调控”“代谢重编程与细胞命运”给出可直接套用的 panel 设计思路。最终提炼出以 p-AMPKα(Thr172) + total AMPKα 为核心，配合 p-ACC、一个 mTORC1 readout（p-S6K1 或 p-4E-BP1）以及自噬或代谢功能指标的 AMPK 通路「必备四件套」，帮助在能量代谢、肿瘤、代谢性疾病等课题中高效判断 AMPK 是否被有效激活及其功能后果。

本篇聚焦 Stress MAPK（JNK/p38）在氧化应激、紫外线、细胞因子和毒性药物等场景下的经典检测指标，从上游 MKK4/7、MKK3/6，到 p-JNK/p-p38，再到 p-c-Jun、p-ATF2、p-MK2 及 AP-1 活性，系统梳理“应激三连击”与下游功能输出的 readout 组合。文章按照 UV/ROS 模型、LPS/细胞因子炎症模型、化疗药物诱导凋亡和 JNK/p38 抑制剂药效验证四类实验场景，给出可直接套用的 panel 设计，并对比 Western blot、免疫荧光、报告基因、ELISA 与流式凋亡检测在不同研究问题下的选型思路，方便快捷搭建应激与炎症相关的信号通路指标库。

本篇以 Wnt/β-catenin 通路为主线，同时特别强调 Wnt5 相关的非经典信号分支。文章列出 β-catenin 核转位、TCF/LEF 报告基因活性、Axin2/c-Myc/Cyclin D1 等靶基因表达作为经典 readout，并补充 Wnt5a 介导的极性与迁移相关指标。适合用于肿瘤干细胞、发育生物学和 EMT/侵袭研究场景，便于快速搭建 Wnt panel。

本篇专注于自噬本身的指标体系，而不是重复 mTOR 机制，重点讲清 “启动（ULK1）→ 成核与延伸（Beclin1、ATG5-12）→ 自噬小体/通量（LC3-II、p62、溶酶体）” 三段 readout。文章强调自噬研究必须结合 BafA1/CQ 等抑制剂看 flux，而不能只看 LC3-II 高低，并设计饥饿/Rapamycin、自噬通量评估、线粒体自噬和 ATG 基因敲除等 panel。适合搭配 WB、IF/高内涵、EM 和 Cyto-ID 染色等平台，用于肿瘤、代谢疾病和器官保护课题。